研究發(fā)現(xiàn)人們對(duì)數(shù)千種人類蛋白質(zhì)幾乎一無所知

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一個(gè)被稱為unknome的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫根據(jù)人們對(duì)蛋白質(zhì)的了解程度對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行排名，結(jié)果顯示，人們對(duì)數(shù)千種人類蛋白質(zhì)幾乎一無所知，而其中一些蛋白質(zhì)對(duì)生存至關(guān)重要。8月8日，相關(guān)成果發(fā)表于《科學(xué)公共圖書館—生物學(xué)》。

為了創(chuàng)造unknome數(shù)據(jù)庫，英國劍橋大學(xué)MRC分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的Sean Munro和同事從人類身上發(fā)現(xiàn)的大約2萬個(gè)蛋白質(zhì)基因入手。他們將密切相關(guān)的、可能具有相似功能的人類基因或蛋白質(zhì)組合在一起，產(chǎn)生了大約7500個(gè)蛋白質(zhì)簇。

接下來，他們將在老鼠或果蠅等常見研究動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)的密切相關(guān)的蛋白質(zhì)添加到這些蛋白質(zhì)簇中，因?yàn)檫@些蛋白質(zhì)可能也具有相同功能。然后，他們根據(jù)基因功能主要信息庫中的條目數(shù)量，給每個(gè)蛋白質(zhì)簇打分。

一種沒有被直接研究過的人類蛋白質(zhì)，如果其在另一種動(dòng)物身上的等效蛋白質(zhì)得到了充分研究，它的得分仍然很高。如果蛋白質(zhì)在被認(rèn)為更可靠的條目中出現(xiàn)也會(huì)得到更高的分?jǐn)?shù)，比如發(fā)表在期刊上。 Munro坦言，這種評(píng)分有些武斷，但在試圖弄清人們未知的東西時(shí)，這是不可避免的。

一些蛋白質(zhì)被研究得十分透徹，因此其得分遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過100。例如，一種參與胚胎發(fā)育的名為音猬因子的蛋白質(zhì)得分為168，而幫助阻止細(xì)胞癌變的蛋白質(zhì)p53得分為126。然而，仍有超過2200種蛋白質(zhì)的得分低于2、1100種低于1、超過800種為0。

理論上，這些得分低的蛋白質(zhì)可能沒有被研究過，因?yàn)樗鼈儧]有任何重要的作用。為了解這些蛋白質(zhì)是否重要，研究小組使用了一種名為RNA干擾的技術(shù)，降低果蠅中260種得分低于1的蛋白質(zhì)的水平。在60個(gè)案例中，果蠅死亡，這表明這些特殊的蛋白質(zhì)具有重要的功能。

Munro說，這對(duì)研究果蠅的團(tuán)隊(duì)成員來說是一個(gè)很大的驚喜?！八麄冎皇羌僭O(shè)已經(jīng)找到了所有可能的重要基因，事實(shí)證明并非如此?！?/p>

他說，未知蛋白質(zhì)的數(shù)量正在慢慢減少，但他希望加快發(fā)現(xiàn)的步伐。目前的問題是，資助機(jī)構(gòu)和研究人員都不愿意冒險(xiǎn)研究未知蛋白質(zhì)，因?yàn)樗麄儞?dān)心相關(guān)的研究工作無足輕重從而無回報(bào)。

“甚至可能有我們不知道的生物過程，但沒有人在尋找與這一過程有關(guān)的蛋白質(zhì)，因?yàn)闆]有人知道它們?！盡unro說，這聽起來可能令人驚訝，但被稱為CRISPR的基因編輯技術(shù)是基于細(xì)菌蛋白質(zhì)的，后者的功能直到2012年才被發(fā)現(xiàn)。

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