我國科研團隊發(fā)布水稻完整參考基因組

科技日報北京8月23日電 (記者馬愛平 通訊員馬昕怡)水稻是重要的糧食作物，其基因組組裝對水稻育種意義重大。23日，記者從中國農業(yè)科學院深圳農業(yè)基因組研究所獲悉，該所聯合崖州灣實驗室、中國水稻研究所、中國農科院作物科學研究所和揚州大學等多個單位發(fā)布完整的水稻參考基因組，實現了全基因組所有染色體端粒到端粒無缺口組裝，為水稻育種研究提供了新的有力工具和重要大數據基礎。相關研究成果日前發(fā)表在《分子植物》(Molecular Plant)上。

2005年，水稻品種“日本晴”基因組草圖發(fā)布，水稻研究正式跨入基因組學時代。

此后，“日本晴”參考基因組在2013年進一步更新，大幅改善了基因組組裝結果和基因注釋，成為水稻的標準參考基因組，一直沿用至今。然而，由于當時測序和組裝技術限制，該基因組對復雜結構區(qū)域的組裝存在占全長3%左右的缺口，這些缺口阻礙了水稻育種的研究進程。

論文通訊作者、中國農業(yè)科學院深圳農業(yè)基因組研究所研究員商連光介紹，為此，研究團隊以水稻“日本晴”為材料，綜合利用新一代測序技術，完成了“日本晴”參考基因組的完整組裝，其大小為385.7百萬堿基對，每條染色體的端粒到端粒均由一條完整連續(xù)的序列組成，堿基精確度超過99.9999%，最新的組裝新增了12.5百萬堿基對的基因組序列，主要解鎖了水稻基因組中結構最為復雜的核糖體DNA序列、著絲粒區(qū)域、復雜轉座子序列和端粒區(qū)域等，修正了多個由于缺口導致的基因結構錯誤，新增了1324個蛋白編碼基因注釋，該研究為水稻育種研究奠定了重要理論基礎。

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